Charges médecin libéral : comprendre le coût réel de votre activité
Les charges sont des dépenses obligatoires qui prennent différentes formes (Impôt sur le revenu, prélèvements sociaux obligatoires, dépenses professionnelles…). Ces dépenses sont à intégrer dans le calcul de la rémunération du médecin car elles sont à retrancher du chiffre d’affaires. On vous explique tout par ici 👇
- La totalité des consultations encaissées par le médecin libéral représente son chiffre d’affaires (CA), auquel on retranche les charges pour obtenir la rémunération nette.
- Il existe 3 types de charges : sociales (cotisations), fiscales (impôts) et professionnelles (loyer, leasing auto, abonnements, matériel…).
- Cumulées, elles représentent environ 40 à 50 % du CA annuel.
- Un statut optimisé permet d’augmenter la rémunération annuelle des médecins.
- Les charges professionnelles sont déductibles du bénéfice imposable à condition de bien les justifier.
Qu’appelle-t-on « charges » pour un médecin libéral ?
Différence entre charges sociales, fiscales et professionnelles
👉 Charges sociales : cotisations obligatoires (sécu, retraite, etc.)
👉 Charges fiscales : impôt sur le revenu, CFE, TVA
👉 Charges professionnelles : locaux, matériel, personnel, véhicule, formation, etc.
Charges obligatoires vs charges variables
Certaines charges, comme les cotisations pour la sécurité sociale, sont obligatoires. D’autres sont soumises à des variables en fonction de votre volume d’activités ou de vos choix dans la conduite de votre métier.
Deux exemples :
👉 Les charges pro dépendent de vos choix : loyer ou crédit professionnel, formation médicale, déplacements, véhicule pro, abonnements à des logiciels métier…
👉 La charge fiscale varie en fonction de votre choix de régime juridique et de votre volume d’activités.
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Les charges sociales du médecin libéral
Cotisations URSSAF
Le médecin non salarié paie sa cotisation auprès de l’URSSAF chaque mois ou trimestre pour les prestations suivantes :
- Assurance maladie-maternité
- CSG-CRD
- Allocations familiales
Cotisations retraite CARMF
Le médecin libéral cotise pour sa retraite auprès de la Caisse Autonome de Retraite des Médecins de France, la CARMF. Elle regroupe aussi la prévoyance en cas de décès ou invalidité. Ces cotisations sont prélevées deux fois par an, sur la base des revenus (avec un plafond de cotisation).
CSG et CRDS
La contribution sociale généralisée (CSG) et la contribution pour le remboursement de la dette sociale (CRDS) sont deux impôts sociaux obligatoires que chacun cotise. En libéral, il est calculé et prélevé par l’URSSAF selon les taux suivants :
👉 CSG = 9,70 % du CA
👉 CRDS = 0,50 % du CA
Prévoyance et invalidité-décès
La prévoyance et l’invalidité-décès sont intégrées à la cotisation retraite CARMF des médecins. Le médecin, en cas d’accident de la vie, sait que sa famille est protégée (rentes ou allocations pour le conjoint ou les enfants mineurs en cas d’invalidité ou décès).
Les charges fiscales du médecin libéral
Impôt sur le revenu (BNC)
Le médecin installé déclare ses impôts en micro-BNC par défaut. Mais le micro bnc en profession libéral a aussi ses limites (plafond de revenus fixé à 77 700 € par an en 2025) et il peut être intéressant de basculer vers le régime de la déclaration contrôlée afin de pouvoir déduire des frais professionnels de votre base imposable.
Contribution foncière des entreprises (CFE)
La CFE doit être réglée par tout travailleur indépendant ou toute entreprise, même sans posséder de local professionnel. Un avis de CFE est émis chaque année :
- Si le montant est < 3 000 €, le paiement se fait en une fois à la date limite du 15/12 ;
- Si le montant dépasse le plafond de 3 000 €, le paiement peut se faire en deux fois (acompte en juin et solde avant le 15/12) ou bien être mensualisé.
TVA : médecins concernés ou exonérés
Les médecins libéraux sont exonérés de TVA, mis à part dans les cas suivants :
- Médecins qui pratiquent des actes de médecine ou de chirurgie esthétique non pris en charge par la sécurité sociale ;
- Médecins propharmaciens ;
- Médecins exerçant en clinique qui réalisent des prestations annexes aux soins médicaux remboursés par l’Assurance maladie ;
- L’expertise médicale dans le cadre d’une procédure judiciaire ou d’un contrat d’assurance ;
- Les médecins-conseils qui sont consultants pour un laboratoire pharmaceutique ou autres entreprises.
Les charges professionnelles liées à l’exercice médical
Loyer et charges du cabinet
Un médecin libéral doit souscrire à un bail immobilier ou souscrire à un crédit pour pouvoir accueillir ses patients en consultation. Que ce soit par le biais de loyer ou de mensualités d’emprunt, il s’agit de la dépense principale des médecins libéraux. Mais ces dépenses sont déductibles !
Matériel médical et informatique
Les médecins doivent avoir le meilleur matériel médical pour effectuer leurs consultations. L’acquisition de ce matériel a un coût non négligeable mais comme il fait partie des dépenses pro, c’est possible de le déduire. Idem pour les ordinateurs utilisés pour les consultations.
⚠️ Si l’ordinateur pro du praticien est aussi utilisé à des fins persos, il faut le passer en frais mixtes. Par exemple, si vous considérez que l’usage de l’ordi acheté 1 000 € est à 30 % perso et 70 % pro, 70 % de sa valeur est déductible en frais pros (et non 100 %), soit 700 €.
Personnel et secrétariat
Comme dans n’importe quelle entreprise, un médecin a besoin de ressources humaines. Dans son cas, il a besoin pour son secrétariat ou l’entretien de son cabinet (ménage, sécurité, blanchissage du linge…). Il peut soit recruter directement lui-même, soit mettre en commun avec d’autres praticiens ou bien faire appel à un prestataire extérieur.
Assurance professionnelle (RCP)
Le médecin libéral est obligé de souscrire à une responsabilité civile professionnelle en cas d’erreur médicale pouvant causer du tort aux patients. Le coût de cette assurance est aussi remboursable.
Quel est le poids des charges pour un médecin libéral ?
Pourcentage moyen des charges sur le chiffre d’affaires
Si l’on additionne toutes les charges du médecin installé ou remplaçant, on considère que cela représente entre 40 et 50 % de son chiffre d’affaires annuel.
Différences entre généraliste et spécialiste
La principale différence entre le généraliste et le spécialiste, c’est le matériel médical. En effet, de nombreuses spécialités exigent un matériel lourd (radiologie, ophtalmologie, etc.).
Aussi, certains achètent du matériel de pointe, qui coûte forcément plus cher. Or, l’administration fiscale fixe un plafond de déduction, ce qui fait que certaines machines peuvent rester à charge du praticien qui doit ensuite les rentabiliser en faisant payer plus cher ses consultations.
Charges d’un médecin remplaçant vs installé
Un médecin remplaçant a moins de frais professionnels fixes qu’un médecin installé car il bénéficie d’une structure déjà en place. En revanche, il paie l’occupation de cette structure dans le calcul de la rétrocession d’honoraires.
Cette rétrocession, fixée à l’avance, correspond à la somme reversée par le praticien remplacé à son remplaçant. En clair, le cabinet encaisse les paiements des consultations et le remplaçant se voit rétrocéder une part (souvent autour de 70-80 %) de ces paiements. Les 20 à 30 % restants comprennent les frais mais aussi la réputation du cabinet, par exemple.
Charges médecin libéral : exemples chiffrés
Médecin généraliste en cabinet individuel
Laetitia, généraliste conventionnée en secteur 1 exerce en cabinet individuel. Elle génère un CA de 120 000 € par an. En se basant sur les taux en vigueur en 2026, ses cotisations et contributions (Urssaf et Carmf) s’élèvent à 28 155 €. Ses charges professionnelles s’élevant à 9 000 € par an, sa rémunération nette annuelle est de 82 845 €.
Comme Laetitia déclare ses bénéfices en régime de la déclaration contrôlée, elle peut déduire des charges professionnelles de son bénéfice imposable. Son impôt sur le revenu est donc de 19 143 €.
Au final, il lui reste 63 702 €, soit un peu plus que la moitié de son CA annuel.
Médecin spécialiste avec structure plus lourde
Marion, spécialiste conventionnée secteur 1, est associée au sein d’un cabinet partagé en région parisienne.
Son CA annuel est de 180 000 €.
Cotisations : 32 990 € par an
Le revenu net imposable est donc de 102 010 €
Charges professionnelles : 45 000 € par an
- Loyer = 30 000 €
- Fonctionnement (charges de copro, énergie, entretien…) = 6 000 €
- Matériel pro et informatique = 5 000 €
- Assurances professionnelles = 500 €
- Abonnements plateformes, téléphonie et logiciel métier = 3 500 €
L’impôt sur le revenu de Marion après déduction de ses charges est de 27 268 € par an. Au total, il lui reste donc 74 742 €, soit moins de la moitié de son CA annuel.
Dans son cas, il aurait mieux valu opter pour un passage en société (par exemple en SELARL). Marion aurait pu s’octroyer une rémunération de 75 000 € (et donc payer l’Impôt sur le revenu sur 75 000 €) et passer le reste de ses bénéfices en société avec une imposition sur la société (IS). Le reste de ces bénéfices peuvent être réinvestis ou gardés en trésorerie pour être versés plus tard sous forme de dividendes.
Découvrez dans la partie suivante comment mieux optimiser vos revenus en tant que médecin installé👇
Comment optimiser les charges d’un médecin libéral ?
Déduction des frais professionnels
La déduction de vos frais pro est la clé d’une optimisation de la rémunération. Pensez donc à bien lister vos dépenses et à conserver vos justificatifs. Cela peut être un contrat de leasing en profession libéral, une facture d’achat de matériel médical, une facture d’abonnement à un logiciel, etc.
Choix du mode d’exercice (individuel, société)
Comme on l’a vu en amont, le choix de votre statut conditionne vos revenus. De nombreux praticiens déplorent leur manque de connaissances sur le sujet de l’optimisation. Il est donc important de faire appel à des pros pour prendre les bonnes décisions !
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Anticipation des cotisations et trésorerie
Il est important de ne jamais vous retrouver à court de trésorerie ! Les cotisations CARMF ayant par exemple lieu deux fois par an, ce sont de grosses sommes qui sortent de votre compte… Anticipez en faisant en sorte de ne pas avoir d’achat important à ce moment de votre exercice.
Accompagnement par un expert-comptable
En tant que libéral, vous devez gérer votre compta comme dans n’importe quelle entreprise : vous avez donc besoin d’un expert-comptable pour vous soulager dans votre gestion comptable. Mais il est important de faire appel à des professionnels qui connaissent bien vos problématiques !
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FAQ
Quel pourcentage du chiffre d’affaires part en charges pour un médecin libéral ?
Si l’on cumule toutes les charges (sociales, fiscales et professionnelles) du médecin libéral, cela représente environ 40 à 50 % de son chiffre d’affaires. Si les charges dépassent ce « plafond idéal », c’est que votre statut n’est pas adapté… Vite, contactez Hiway pour remédier à ce problème !
Un médecin libéral paie-t-il la TVA ?
Un médecin libéral est exonéré de TVA sauf s’il exerce dans les conditions suivantes :
- Actes de médecine ou de chirurgie esthétique non pris en charge par la sécurité sociale ;
- Médecins propharmaciens ;
- Médecins exerçant en clinique qui réalisent des prestations annexes aux soins médicaux remboursés par l’Assurance maladie ;
- Les expertises médicales dans le cadre d’une procédure judiciaire ou d’un contrat d’assurance ;
- Les médecins-conseils qui sont consultants pour un laboratoire pharmaceutique ou autres entreprises.
Les charges sont-elles les mêmes pour un remplaçant ?
Un médecin remplaçant paie aussi des charges sociales et fiscales. Ses charges professionnelles sont en revanche moins élevées car il n’a pas de lieu de consultation. En revanche, le médecin remplacé lui prélève une partie de sa rémunération au titre d’occupation des lieux et de participation aux charges.
Comment estimer son revenu net après charges ?
Pour estimer son revenu net après charges, il faut lister l’ensemble des dépenses professionnelles et anticiper les cotisations sociales et l’impôt sur le revenu. Des outils existent pour le calcul de l’ensemble des charges mais le mieux est de faire appel à des pros comme Hiway, spécialiste de l’accompagnement des médecins libéraux.
